姚治学态度严谨，从事教育多年，“接来学者千余辈，教成楚材”，为时所称。他大力推行教育改革，鼓吹教育内容必须向科学演变，提出“才能须应万变，学业岂拘五经”；向学生介绍西欧及日本科学、民主思想，增加新课程；亲自选派优秀学生出国留学，为湖北培养
科技教育人才。
著作有《三家书义发微》、《春秋备疏》、《经论》、《礼经杂记》、《汉志矿地记》、《九宫随释》、《小学教育法》等20余种。不仅在音韵学、词章、考据、训诂上造诣很深，对医学亦有研究。
1916年病故，总统黎元洪以其“学术精通，道德纯备”，明令国史馆为之立传。