保护区始建于1991年，是敦化市政府批准成立的第一个县级自然保护区。
2002年晋升为省级自然保护区。
2007年4月晋升为国家级自然保护区。
吉林雁鸣湖国家级自然保护区
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历史沿革
地理环境
位置境域
吉林雁鸣湖国家级自然保护区位于吉林延边朝鲜族自治州敦化市境内，地处长白山脉张广才岭南麓，东与黑龙江省宁安县相邻，北与黄泥河林业局接壤，西南与敦化市官地镇、额穆镇、黑石乡相连，东南与敦化林业局相接，地理坐标为东经128度11分40秒至128度45分30秒，北纬43度39分20秒至43度51分28秒。保护区总面积为53940公顷，其中，核心区面积19649公顷，占保护区总面积的36.4%；缓冲区面积24846公顷，占保护区总面积的46.1%；试验区面积9445公顷，占保护区总面积的17.5%。
地形地貌
气候
保护区气候属中温带大陆性湿润季风气候，气候特点是春秋短暂、凉爽少雨，夏季温暖、雨量充沛，冬季漫长寒冷，年平均气温4.3摄氏度，无霜期平均为120天左右。
水文
该保护区是吉林省河流密度较大的地区之一，松花江一级支流牡丹江自保护区西端入境，由西向东横贯保护区南部，流经保护区的长度为53公里，流域面积2383.5 公顷,年径流量26.8亿立方米。
自然资源
湿地资源
根据《湿地公约》分类系统，及《全国湿地资源调查与监测技术规程》的分类标准，雁鸣湖保护区的湿地可划分为8种湿地类型，分属于天然与人工两大湿地系统。天然湿地有3大类6种类型：即永久性河流湿地、洪泛地、永久性淡水湖泊湿地、森林沼泽、灌丛沼泽与草本沼泽；人工湿地有2种类型：即水田和水库。与吉林省湿地类型比较，湿地类型占吉林省的57.5%，是吉林省湿地资源较为丰富的区域之一。
该区湿地面积为18905公顷，占该区总面积的35.0%。其中天然湿地面积为17357公顷，占该区湿地面积的91.8%；人工湿地面积为1548 公顷，占该区湿地面积的8.2%。
在天然湿地中，面积最大的是森林沼泽，面积为8100 公顷；占天然湿地面积的46.7%；其次是河流湿地，面积为2800 公顷，占天然湿地面积的16.1%；居于第三位的是草本沼泽，面积2450 公顷，占该区天然湿地面积的14.1%；洪泛地面积为1600 公顷，占天然湿地面积的9.2%；灌丛沼泽面积为1545 公顷，占天然湿地面积的8.9%；面积最小的为湖泊湿地，面积为862 公顷，占该区天然湿地的5.0%。
该区人工湿地以水库为主，面积895 公顷，占该区人工湿地的57.8%，其次为水稻田，面积653 公顷，占该区人工湿地面积的42.2% 。
森林沼泽
森林沼泽以白桦--沼柳--臌囊台草沼泽为主，灌丛沼泽以柴桦--乌拉苔草沼泽和沼柳--尖嘴苔草沼泽为主。草本沼泽以浮毡沼泽，臌囊苔草沼泽，芦苇沼泽和杂类草沼泽为主，浮毡沼泽是该区草本沼泽的主要类型，分布较广，面积较大的有漂筏苔草沼泽，塔头苔草沼泽两种。漂筏苔草沼泽是吉林省最具典型性的沼泽类型，丰富了明水域的异质性，为水鸟栖息提供了优良的空间条件。由于浮毡的遮盖，降低了"漂筏"下河流水体的温度，为冷水性鱼类的产卵、索饵创造了适宜的水域环境。
保护目标
保护对象
根据《自然保护区类型与级别划分原则》的划分标准，该保护区属于"生态系统类"类别，"内陆湿地和水域生态系统"类型的自然保护区,主要保护对象为牡丹江上游湿地及黑鹳、东方白鹳、丹顶鹤等珍稀濒危水禽及东北虎迁移的重要廊道。
动物
野生脊椎动物34目90科212属368种。其中鱼类5目12科34属44种、两栖类2目6科6属12种、爬行类3目4科8属13种、鸟类17目51科129属251种、兽类6目16科34属45种。国家I级重点保护的野生动物7种，兽类2种、鸟类5种，即黑鹳、东方白鹳、丹顶鹤、中华秋沙鸭、金雕、东北虎、原麝；国家II级重点保护的野生动物42种，兽类7种、鸟类35种，如鸳鸯、花尾榛鸡、黄嘴白鹭、黑熊、棕熊、猞猁等
植物
高等植物63目143 科、512属、1460种，其中苔藓植物11目24科35属50种，蕨类植物8目20科35属81种，种子植物44目99科442属1329科（其中裸子植物1目2科6属11种，被子植物43目97科436属1318科）。另外还有地衣植物1目17科27属57种。国家Ⅰ级保护植物有东北红豆杉1种，国家Ⅱ级重点保护野生植物有8种：红松、水曲柳、黄檗、野大豆、莲、胡桃楸、紫椴和刺五加。
旅游资源
保护区有以雁鸣湖、塔拉湖为主的大小水域80余处，盛产各种野生淡水鱼和莲藕，山、水、林组合极佳，“小桥、流水、人家”的乡村气息极浓，是休闲、避暑、度假的旅游佳地。景区内的沿牡丹江上游水域形成的湿地生态系统，既是陆地上的天然蓄水库，又是众多野生动植物资源，特别是国家一级保护物种黑鹳等珍稀水禽繁殖地、迁徙地、越冬地。景区内的雁鸣湖镇历史悠久，镇内历史遗迹颇多，最著名的腰甸“二十四块石”，在研究东北民族历史文化、研究渤海时期的交通和建筑等方面，具有极高的现实意义和历史价值。
雁鸣湖生态旅游度假区已建设有丹江山庄、映山湖度假村、塔拉湖度假村等，建成了小山鱼文化生态村和大山生态农业村，形成了镇郊生态旅游、雁鸣湖鱼村风光旅游、丹江休闲度假旅游三大生态旅游功能区，开发出生态美食产品4个系列的生态旅游产品和一个雁鸣湖活鱼节节庆会展活动，推出了钓鱼、捕鱼等旅游项目。
管理现状
保护区成立了保护区管理局，下设6个职能部门和大山、大沟、四海店三个保护管理站。敦化市制定了《吉林雁鸣湖自然保护区管理办法》、《在保护重点湿地内禁牧的规定》及《保护区内居民十不准》等规范性管理法规和文件。几年来，成功拆除了保护区内一处个体加油站，打击各类破坏林地、侵占湿地、乱捕乱杀野生动物案件20多起，释放被抓野生动物30多只。截至2009年，保护区内共完成退耕还林1500公顷、还草300公顷、还湿70公顷，林下冠造林2500公顷，使保护区内森林覆盖率由2000年的49、5%提高到2004年的51、8%。
为了加大对湿地生态系统及珍稀鸟类的监测力度，保护局设立专门人员在黑鹳、东方白鹳等珍稀水鸟的重要栖息地常年管护。架设人工生态围栏80多公里，修筑巡护公路34公里，实施退耕还林、还湿3000多公顷。设置保护区界桩170根。并投资100多万元，购置了3台巡护车辆，在车内配备了微机、摄像机、照相机、高倍望远镜等设备。2009年6月份，保护区工作人员在小山水库外的西大泡附近首次发现并记录下了国家一级重点保护野生鸟类——东方白鹳。此外，敦化市还在大山、大沟、四海店三处建立保护管理站，聘任了21名巡护员。投资200万元、建筑面积2000多平方米的保护区综合楼也即将建成并投入使用。
2006年，野生动植物标本陈列馆建成，面积200多平方米，是敦化市第一个面向中小学生开放的集科研、科普于一体的野生动植物标本陈列馆，也是敦化市首家动植物标本室。有兽类标本8种、鸟类12种、两栖爬行类14种、鱼类8种、昆虫类300多种、科普教育类100多种。
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