反转录病毒
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基本特征
特点
LTR的分析
LTR对病毒DNA整合进宿主细胞基因组和控制病毒RNA合成均有重要作用。同时，它具有真核生物基因表达时所需的基本功能，例如，启动作用、起始作用和转录物的多聚腺嘌呤加尾作用等。LTR的DNA序列已经测定，不同种的病毒的LTR长度不同，变动范围在250～1,400 bp之间，LTR的长度变化主要取决于U3的长度，它的变动范围在170—1,260bp之间。
在LTR的两端各有一个反向重复序列。所有LTR的两端都是以TG...CA和AC…GT为标志。在未整合进宿主细胞基因组中的LTR的两端还各有两个碱基对，即AATG…CATT和TTAC…GTAA，这两个碱基对在LTR整合进宿主细胞基因组时会丢失。LTR在U3区内有同"TATAA"框十分相似的序列。TATTA框是真核生物中使用RNA多聚酶Ⅱ的转录单位所特有的序列。真核类基因转录时大部分用RNA多聚酶Ⅱ，TATAA框就是这类酶的接触位点。所以LTR很可能利用宿主细胞的RNA多聚酶Ⅱ来启动基因的转录。LTR的R—U5分界线上游20bp处还有AAG TAAA序列，这是真核生物都有的腺嘌呤核苷酸聚合作用的信号。
在U5区内，距离R区10~25 bp处有TTGT或类似序列，这是病毒RNA合成的终止信号，这对终止病毒RNA的合成可能起重要作用。在U3—R分界线处还常有一个反向重复序列，这对终止病毒RNA的合成可能也有重要作用。除此之外，左边LTR的U3区启动子负责启动前病毒的转录，右边LTR的U3区启动子有时能启动位于前病毒插入位点下游的宿主DNA序列的转录，不过这种情况很少发生。LTR中还有增强子序列，可以增强病毒RNA的转录能力，或对前病毒DNA两侧的宿主DNA的转录活性起调控作用。
常见种类
亚科名 —— 代表病毒
（1）RNA肿瘤病毒亚科
（禽类）rous肉瘤病毒（RSV），rous 相关病毒（RAV），其他鸡肉瘤病毒,禽白血病病毒（ALV）
（哺乳类）鼠肉瘤病毒（MSV），鼠白血病毒（MLV），鼠内源性病毒，猪肉瘤病毒，牛白血病病毒，猪白血病病毒，鼠乳腺瘤病毒
（灵长类）灵长类肉瘤病毒，猴白血病病毒，狒C型肿瘤病毒，mason-pfizer猴病毒（MPMV），langur病毒
（人）人类嗜T细胞病毒Ⅰ型，Ⅱ型，Ⅴ型（HTLV-Ⅰ，Ⅱ，Ⅴ）
（2）慢病毒亚科
人类免疫缺陷病毒（HIV），绵羊脱髓鞘性脑白质炎病毒（visnavirus），绵羊肺腺瘤病毒（maedi virus），马传染性贫血病毒（EIAV）
（3）泡沫病毒亚科
灵长类泡沫病毒，猫，牛，人泡沫病毒（human foamy virus）
此外，注意：SARS冠状病毒不是逆转录病毒。
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