关于南美草原猫在分类学上的位置恐怕处在争议中,有人在对博物馆90多个标本进行研究后,提议将它们放置在Lynchailurus属中,并分为三种(1994),即Lynchailurus pajeros(厄瓜多尔至巴塔哥尼亚地区的
安第斯山脉附近);L.braccatus(巴西、巴拉圭、乌拉圭);L.colocolo(智利),当然这还需要对其DNA进行进一步的分析才可验证。而按照传统分类法,南美草原猫则有7或8个亚种之分。
Oncifelis colocolo colocolo --
指名亚种智利中部
Oncifelis colocolo braccata -- 巴西、阿根廷北部
Oncifelis colocolo budini -- 阿根廷
Oncifelis colocolo crespoi -- 智利南部
Oncifelis colocolo garleppi -- 秘鲁、厄瓜多尔、玻利维亚
Oncifelis colocolo pajeros -- 阿根廷、智利
Oncifelis colocolo thomasi -- 厄瓜多尔