南京监狱积极推进监狱全面质量建设战略，较好地贯彻落实了“惩罚和改造相结合，教育和劳动相结合，将罪犯改造成为守法公民”的监狱工作方针。监狱坚持公正文明执法，实行狱务公开制度，
并聘请了社会“执法监督员”。监狱注重对罪犯的教育改造，全面开展政治法律、文化知识和劳动技能教育，通过羊毛衫、服装等劳务加工对罪犯进行劳动改造和技能培训，并在民盟南京市委等十多家单位支持下，对罪犯进行社会帮教。监狱注重保障罪犯的合法权益，积极推进“择警谈话”制度，成立了罪犯心理健康指导中心、特困家庭帮扶基金，接受驻地法律援助部门，为罪犯提供及时的法律咨询和帮助。监狱重视监区文化建设，设有省监狱局多媒体中心、希望艺术团一团，每年举行罪犯运动会或文化节。监狱是省委政法委、省级机关工委等十多个部门指定的干部警示教育基地。
南京监狱坚持“传承文明、求实创新、科学人文、勇于争先”的监狱精神，率先实行数字化管理，加强“法制化、科学化、社会化”建设，积极创建最安全监狱、法治文明监狱，为建设“平安江苏”、“法治江苏”增光添彩!