酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合，从而改变酶的活性，这一过程称为酶的共价修饰或者化学修饰。在共价修饰过程中，酶无活性（或低活性）与有活性（或高活性）两种形式的互变，这两种互变由两种催化不可逆反应的酶所催化，后者又受激素调控的调控。酶的共价修饰包括磷酸化与脱磷酸化(蛋白激酶催化蛋白质的磷酸化；蛋白质磷酸酶催化去磷酸化反应。)、乙酰化与脱乙酰化、甲基化与脱甲基化，腺苷化与脱腺苷化，以及-SH与-S-S-的互变等，以磷酸化修饰最为常见。 　如p53蛋白的磷酸化与去磷酸化及乙酞化与去乙酞化。前一种形式的共价修饰主要发生在p53分子的N一末端和G末端,后一种形式的共价修饰发生在p53分子的G末端。