户部仓场衙门设于顺治元年，最高长官称“总督仓场侍郎”，为正二品。据《光绪会典》等载，仓场衙门分设东、西、漕等各科，分掌各仓场。何谓“仓场”？这即是有名的“京、通十三仓”。我们今天仍可见东直门内小街往南迤逦有海运仓、北新仓、禄米仓等地名，即为清代“十三仓”的遗留。其中唯有南新仓修缮保留，俾使今人可窥漕粮仓储风貌。
“十三仓”也称“京仓”。计有禄米、南新、旧太、海运、北新、富新、兴平、太平、储济、本裕、丰益十一仓，加上通州中仓、西仓，总计十三仓。多为明代所建，清代有所增加。每仓各设满、汉监督二人管理。各省漕粮运抵通州，按粮石种类与支放用途，分别储入京、通十三仓。除十三仓外，户部还单设“内仓”。清室内务府也单设“恩丰仓” （太监米石）、“官三仓”（储米石、麦等）。不属户部，归内务府会计司管辖。
上述各仓所储粮米，苏、浙两省征收的“白粮”（粳米、糯米），仅供皇室内府及王公、百官食用。其他漕粮支放八旗官俸兵米及养马饲料。北京东城的钱粮胡同即为八旗官兵领取俸米处。“漕粮”支出有严格规定，绝不准许平民食用。只有三种情况下才可以变通卖给平民：“廒底成色米”（过期霉变）、“扫收零撒土米”和“仓粮有余”。