四十九年出为安徽巡抚岁旱请留漕粮五万石关税银三十五万两赈之阜阳有荒地六千馀顷疏请宽限清厘民间交易用官弓丈量以杜欺隐期于渐复旧额帝以书麟尽心民瘼予优叙黄运两河漫溢帝因两江总督李世杰未谙河工命书麟佐之与世杰及河督李奉翰议漫口有四惟司家庄汤家庄两处分溜急兴工堵筑又奏桃源境内河流因顺黄坝生有淤滩水势纡折不畅于玉皇阁下挑引河俾黄流东注会清以资宣泄

五十二年擢两江总督书麟素行清谨出巡属邑轻骑减从民不扰累特诏嘉之和珅柄政书麟与之忤未几有高邮巡检陈倚道揭报书吏假印重征事遣重臣鞫实坐书麟瞻徇下部严议又失察句容书吏侵用钱粮褫职遣戍伊犁寻起为山西巡抚内阁学士尹壮图论州县亏空由于派累疆臣中惟李世杰书麟独善其身和珅尤忌之命壮图赴各省清查仓库自山西始壮图因获谴五十六年仍授两江总督两淮盐政巴宁阿交结商人坐书麟徇庇复夺职予三等侍卫赴新疆效力

嘉庆四年和珅败召授吏部尚书兼正红旗汉军都统加太子少保寻协办大学士授闽浙总督弟广兴以首发和珅奸擢官既得官多所弹击书麟不善所为尝于帝前言之至是广兴以掌四川军需获咎书麟请严治且自引罪诏宥之调云贵鞫前督富纲得其贪婪状论如律又按问云南巡抚江兰讳灾得实褫江兰职时裸夷不靖疏陈江兰所奏不实办理草率帝嘉其公正遂亲赴黄草坝督兵分路进剿擒贼首李文明等遣降裸入箐招谕晓以利害夷众五十二寨悔罪输诚以土司苛派扰夷立牌申禁优诏褒赉加太子太保

五年调湖广督师剿襄阳青蓝黄三号教匪会长龄等已败贼瓦房口书麟以东川保丰为粮运要路亲往截剿帝念其年逾七旬奔驰山谷间贼情诡诈戒毋冒险轻试六年由竹山房县进剿徐天德擒斩甚众疏言剿贼之法以固民心培民气为要抚辑得宜贼即是民任其失所民即是贼帝俞之川匪苟文明等由陕西平利越老林图窜房县偕长龄明亮进击遇贼狮子崖大败之复分兵伏佘家沟高尖山天德等来袭却之疏请于襄阳添设提督移协镇于郧阳竹山二处天德等屯聚茅伦山令孙清元等分队破之因病乞解职遣侍卫率御医驰视未几卒于军帝深惜之赠太子太傅封一等男爵以子吉郎阿嗣谥文勤寻以倭什布治饷迟误诏斥书麟知而不举念其清廉公正治军成劳奠醊恩礼仍有加焉