gap penalty
[0787] 当测定序列同一性时应该使用空位罚分(Gap Penalties)，然后优选地将如下参 数用于双序列比对：
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一种设置空位罚分策略 affine gapenalty
空位拓展罚分 gap extension penalty
空位扩展罚分 Gap extension penalty
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以前的研究表明不同的空位罚分可能导致不同的比对结果。
Previous research shows that different gap penalties maybe result in different alignments.
youdao
对比对结果的统计分析表明，起始空位罚分和延伸空位罚分都显著地影响空位的百分含量。
Statistical results prove that gap opening and extension penalties significantly change the percentage of the gaps.
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