北京大学教育经济研究所成立于1999年。它是由原国家教委、原国家计委和财政部联合支持设立的，是国家教育经济和教育财政问题的重要研究和咨询机构。 教育经济研究所依托于北大教育学院（其前身是北大高教所）。 研究所以宏观教育投资和管理体制为研究重心，以完善学科建设为学术追求，充分发挥研究人员的学术专长，逐步形成了规范实证研究，定量方法与定性方法结合，多学科综合研究的特色。多年来，研究所人员主持和参与了多项国家和部委以及国际机构的重大科研项目，其中许多研究成果得到国内外学术界的高度评价，产生了积极的社会影响。