人体有四大储菌库，即皮肤、鼻咽口腔、泌尿生殖道和肠道，其中以肠道最为重要，这些微生物寄生在体内不引起疾病，当机体抵抗力下降或受外界因素影响时，成为致病菌造成机体感染称之为内源性感染。 内源性感染（endogenous infection）指引起感染的病原体来源于自身的体表或体内的正常菌群，多为条件致病菌或由多种原因引起的菌群失调症等引起。
②自身感染（self infection）又称内源性感染（endogenous infection）指病原体来自于病人本身的感染。因病长期使用抗生素、免疫抑制剂或激素等，病人全身抵抗力降低，即可引起自身感染。
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内源性感染(endogenic infection)是指自身的或同种属其他个体的正常微生物成员引起的感染。例如大肠杆菌、沙门氏菌一般为动物肠道的常住菌或过路菌。
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2．内源性感染 (Endogenous nosocomial Infection) 也称自身感染（autogenous infection) 是指病人遭受其自身携带的感染源侵袭而发生的 感染。如长期使用抗生素引起的菌群失调。
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