1998 年, 可应用于蛋白质折叠计算的含有内隐溶剂 (implicit solvent)的能量函数已由Lazaridis 和Karplus 报告过 [31] .
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显示溶剂(explicit solvent) PME和隐式溶剂(implicit solvent) GB的测试分数资料。用户可透过AMBER 11 NVIDIA测试标准页面,查询到更多由圣地牙哥超级运算中心所提供的详细资料。
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另外需要注意的是虽然选项md是可 隐式水模型(Implicit solvent): 用的,但是对于GPU版本的GROMACS选择了md不再 只有在库仑相互作用力(即参数coulombtype) 是使用蛙跳算法了。
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从Gromacs 4.5开始就支持隐式溶剂模型(implicit solvent),有Still, HTC, OBC三种。
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