CHL1是一种跨膜蛋白,包含N端信号序列、6个免疫球蛋白(Ig)样结构域、5个纤黏连蛋白III(FnIII)重复序列、一个跨膜结构域和含有骨架蛋白锚蛋白(anykrin)识别序列(FIGAY)的保守胞内区。
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II类（IIa和IIb）、III类和V类RPTPs的胞外区结构与细胞粘 附分子（cAM）相似，含免疫球蛋白样结构域、纤溶酶型III（FNIII） 结构域、MAM（meprill，A5，PTPB）和碳酸酐酶（CAB）等。与CAM 不同的是，RPTP的胞内区具有磷酸酶活性结构域。
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基序（PHD），纤连蛋白III型结构域（FNIII），和一个VIN3相互作用的结构域（VID）。遗传作图中的着丝粒区的5号染色体上，6，和1，分别放置TmVIL1，TmVIL2，和TmVIL3基因座。
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