遗传学常用的理论分析方法有：序列联配和数据库搜索方法、多序列比对(multi-sequence alignment)、序列结构域的模式匹配、远亲蛋白序列的技术、碱基相位偏倚(D值)法、密码子使用法、神经网络法、进化树的构建。
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Multi-frame Alignment Sequence 复帧定位顺序
multi-sequence alignment
multi-sequence对齐
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However, when carrying out systematic analysis the general multi-sequence alignment method obviously has its limitation, i. e. it cannot shake off its primary structure.
然而，在进行系统发育分析时通常的序列联配方法有明显的局限性，即无法摆脱一级结构的束缚。
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