美扭椎龙亚科是兽脚亚目坚尾龙类斑龙科里的一个亚科,以前传统的错误分类常把该亚科并入斑龙亚科,但1988年的研究表明该亚科成员骨骼上的独立特征和生理构造,与斑龙亚科有着明显的区别和差异,同时也与非洲猎龙亚科骨骼的差异和区别也很显著,故此单独建立了该亚科。 美扭椎龙亚科曾经包含大龙属和美扭椎龙属以及扭椎龙属,总共三个属,但在2010年的细致研究中,发现大龙和非洲猎龙、乐山龙的亲缘关系更接近,离该亚科的模式属(美扭椎龙属)的亲缘关系较远,所以被分入了非洲猎龙亚科。而扭椎龙经过重新研究发现不属于美扭椎龙亚科甚至斑龙科,故被分出斑龙科归入斑龙超科(但哪一科至今存在争议)。因此,该亚科目前仅剩下美扭椎龙属。