《济宁医学院学报》是由国家出版署批准，山东省教育厅主管，济宁医学院主办的学术性期刊。 1978年，《济宁医专学报》创刊；1987年改名为《济宁医学院学报》。 据2018年4月《济宁医学院学报》编辑部官网显示，《济宁医学院学报》编辑委员会拥有委员25人。据2018年4月中国知网显示，《济宁医学院学报》共出版文献5823篇、总被下载286708次、总被引9364次、（2017版）复合影响因子为0.428、（2017版）综合影响因子为0.340。据2018年4月万方数据知识服务平台显示，《济宁医学院学报》载文量为3279篇，被引量为5841次，下载量为49937次；2015年影响因子为0.51。