1、克隆清除和免疫忽视。 对外周组织特异性自身抗原应答的T或B细胞克隆,不能均在胸腺/骨髓中被消除,它们离开胸腺后,存在于外周淋巴器官和组织中,有机会接触自身抗原,如T细胞克隆的TCR对组织特异自身抗原具有高亲和力,且这种组织特异自身抗原浓度高者,可经抗原提呈细胞(APC)提呈,但此类未经活化的APC表达的辅助刺激分子很少,不能提供第二信号,致此类被自身抗原活化的T细胞发生凋亡,克隆清除。 如T细胞克隆的TCR对组织特异自身抗原的亲和力低,或者这类抗原自身浓度很低,虽由活化的APC提呈,因缺乏第二信号,不足以活化相应的初始T细胞,这种自身应答的T细胞克隆与相应组织特异抗原并存,在正常情况下,不引起自身免疫疾病的发生,称为免疫忽视(immunological ignorance)。若将免疫忽视细胞以适宜量的自身抗原刺激,仍可致免疫正常应答。