叠层石灰岩（stromatolitic limestone）是一种具叠层构造的石灰岩。叠层在平面上是水平层状或呈波状起伏，更常见的是向上凸起；在剖面上则呈大小不一的馒头状或相互平行的掌状体，亦可出现球状体。内部则具平行的细纹层。它形成于蓝绿藻的群体中。蓝绿藻丝状体能分泌出胶状黏液，捕获各种漂移的灰泥球粒，形成富屑纹层（又称亮层）。然后藻细胞生长，分布在富屑纹层的表面，形成富藻纹层（又称暗层）。如此一再重复便形成叠层构造。若构成纹层的成分是白云石则称叠层白云岩。中国震旦纪地层中有大量的叠层石。叠层石常指示潮汐环境。