然而，其具体的调控机制并不清楚，阐述了本课题组通过染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)，找到了AlgR的157个结合位点。其中AlgR直接激活c-di-GMP合成酶MucR，通过调节胞内c-di-GMP的水平而控制细菌生物膜的生成。
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动机：基于抗体的染色质免疫沉淀实验接着高通量测序技术（ChIP-seq）是在整个基因组上研究特定蛋白质分子结合模式的一种相当新的方法。ChIP-seq技术允许科学家在较短的时间内获得更全面的结果。
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他们从MiSeq系统开始，开展转录组测序（RNA-Seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq），并利用基因集合来鉴定实体瘤。2015年1月，他们又增加了NextSeq 500系统，以便获得更高的产量和开展更深度的测序。
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为了探究LANA是否会招募KAP1到KSHV基因组其它区域，研究人员通过染色质免疫共沉淀-深度测序技术(ChIP-seq)，证实了LANA和KAP1在KSHV基因组上有多个共结合位点。
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chip seq 分析流程
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