组成及特征与生态系统的特殊稳定性相联系。地下水中氧的浓度和温度一般不随季节变化,而且比较黑暗。温带地下水温永远在冰点以上。所以，有些古老的动物如第三纪残遗种类，如甲壳类的水螨，一些特殊种类的雪鲺( Niphargus)，起源于海洋,以后通过海岸地下水渗透到内陆洞隙与孔隙地下水环境。

组成及分布主要决定于水流和底质状况因素的影响。小溪、河流上游的水流急湍,含氧较高,温度波动较小，缺乏植物，河底多石质底，具有少数种类的固着动物。为防止被水流冲走，它们具有底栖动物的一些特化现象（身体扁平，具有吸盘、附属器官、粘液腺及其他构造），如蜉蝣和石蝇的幼虫、淡水?、端足类，以及一些石蚕幼虫和摇蚊幼虫等。上游有少数适应急流的鱼类,它们冬季产卵,主要有鳟、鲑、茴鱼等。小溪、河流下游的水流缓慢、氧浓度低、水温波动较大，底质多为沙、泥、粘土或淤泥质，动物类群丰富，多为耐广湿和耐缺氧的种，如蜻蜓幼虫、龙虱、水龟虫、石蚕蝇、水虱和大量水螨。下游鱼类如鲤、狗鱼和鲈鱼等，常在夏季产卵。

此外，河流动物的组成和分布还受河流水位及河源等因素制约。水位较深的河槽中，动物种类、数量丰富，浅滩地段较贫乏；源出于冰雪融化的山区河流，几乎无浮游动物；河流近海地段的浮游动物中出现有海洋种类；流速较小的中下游和近岸处浮游动物较多。

组成和分布主要决定于湖水温度、矿化度、生态环境条件的影响。①温度的垂直分层性。不同地区各水层的性质随季节变化而不同。水温均质层为生产层，以各种淡水浮游生物占优势，如桡足类、叶脚类、软虫和原生动物以及硅藻、蓝藻和细菌等，成为鱼类的食物基地。鱼类区系在均温层地区性差异很大，而浮游动物则具有相对一致性，有许多广布种。深层为消费层和矿化层,缺氧时形成一层淤泥,仅有少数耐低氧的摇蚊、颤蚓和某些软体动物及扁形动物生存。②矿化度。按其大小可分为淡水湖、咸水湖和盐湖3种类型,咸水湖泊所含营养元素较淡水湖贫乏，动物种类单纯，为广耐盐性和狭耐盐性种类。③生态环境。湖泊浮游动物分布还受水流注入的环境及湖底质状况等因素影响。由城镇和耕作地区流入的水较从山溪注入的水,浮游动物种类多;泥底比砂底营养物质多，浮游动物数量也较多。