清华大学化学系始建于1926年，在新中国成立时，已成为国内高校中师资力量最为雄厚、学术水平最高的化学系之一。1952年的高等学校院系调整使清华大学化学系的发展一度中断。为了适应清华大学建设综合性研究型大学的发展需要，1978年在化工系恢复招收“物理化学与仪器分析”专业的理科学生，1980年化工系更名为化学与化学工程系，1985年11月化学系正式恢复建立。化学系于1990年建立物理化学博士点，2000年获化学一级学科博士点，2001年设立化学博士后流动站。复系以来，清华大学化学系已重新建设成为国内重要的化学科学研究和人才培养基地。