该学院(School of Public Health,Peking University)始建于 1950 年，其前身为北京大学医学院公共卫生科。 1952 年北京大学医学院脱离北京大学独立建院，公共卫生科改为公共卫生学系， 1956 年更名为卫生系。 1985 年北京医学院更名为北京医科大学，卫生系更名为公共卫生学院。 2000 年北京医科大学与北京大学合并，组建新的北京大学，北京医科大学更名为北京大学医学部，公共卫生学院为北京大学医学部的一部分。公共卫生学院培养出的本科生、研究生遍布国内外，大多数在预防医学、公共卫生、卫生事业管理及医学教育等领域工作。