东北农业大学农学院于1996年6月成立，由原农学系、植保系二系合并而成，是东北农业大学具有传统优势的骨干支柱学院。它的前身——农艺系创立于1948年，是学校最早设立的三系之一。农学院有4个系（农学系、植物保护系、种子科学与工程系、植物科学与技术系）；农学院设有1个一级学科博士点、2个二级学科博士点，设有1个博士后流动站；农学院有5个学科，均为硕士点学科，其中前四个为黑龙江省重点学科，后一个为校重点学科。农学院还设有农业部寒地作物生理生态重点开放实验室、黑龙江省大豆生物学重点实验室、作物品质分析中心、大豆研究所及12个研究中心和研究室。